Por lo general, para los proyectos de I+D+I existen dos modalidades fundamentales de financiación directa:

• Subvención
• Préstamo.

El esquema de financiación de cada proyecto dependerá de las características del proyecto, su nivel de riesgo y, en ocasiones, del tipo de empresa, existiendo la posibilidad de que un mismo proyecto reciba financiación simultánea en forma de subvención y préstamo.

I. Ayudas Europeas
Sin duda, las más importantes son las concedidas por el Séptimo Programa Marco (FP7) de la Unión Europea para realizar proyectos de I+D, en su mayoría consorciados.  http://cordis.europa.eu/fp7/home_es.html

II. Nivel Nacional
El Centro para el Desarrollo Tecnológico Industrial (CDTI) www.cdti.es es una Entidad Pública Empresarial, dependiente del Ministerio de Ciencia e Innovación MICINN (www.micinn.es), que promueve la innovación y el desarrollo tecnológico de las empresas españolas. Su objetivo es contribuir a la mejora del nivel tecnológico de las empresas españolas mediante el desarrollo de las siguientes actividades:

• Evaluación técnico-económica y financiación de proyectos de I+D desarrollados por empresas.
• Gestión y promoción de la participación española en programas internacionales de cooperación tecnológica.
• Promoción de la transferencia internacional de tecnología empresarial y de los servicios de apoyo a la innovación tecnológica.
• Apoyo a la creación y consolidación de empresas de base tecnológica.

Actualmente se encuentra vigente el Plan Nacional de I+D+i 2008-2011 (www.plannacionalidi.es), que se estructura a través de cuatro áreas temáticas y una serie de Líneas Instrumentales de Actuación desarrolladas a su vez a través de varios Programas Nacionales.

Otros Programas Nacionales
INGENIO 2010 (www.ingenio2010.es): Compromiso que pretende involucrar al Estado, la Empresa, la Universidad y otros Organismos Públicos de Investigación en un esfuerzo decidido por incrementar hasta el 2% del PIB destinado a la I+D en 2010 y un 55% de la contribución privada.
1. Programa Consolider
2. Programa Cenit (Consorcios Estratégicos Nacionales de Investigación Tecnológica)
3. Plan AVANZA (www.planavanza.es)
4. Plan euroingenio

III. Ayudas en la Comunidad Autónoma de Aragón
En la Comunidad Autónoma de Aragón los organismos que financian las actividades de I+D+I de las empresas son:

• Departamento de Industria, Comercio y Turismo del Gobierno de Aragón: 
  • 1º Ayudas a PYMES Industriales, para el refuerzo de la competitividad y mejora de la productividad:
  • 2º Innoempresa:
    Innovación Organizativa y Gestión Avanzada.
    Innovación Tecnológica y Calidad.
    Proyectos de innovación en colaboración.
• Instituto Aragonés de Fomento (IAF):
  • Apoyo a las PYMES en el proceso inversor necesario para hacer posible la ampliación y modernización de las estructuras productivas ya existentes, así como el desarrollo de otras nuevas en sectores de futuro.
    ICO-PYME 2008.
    ICO-EMPRENDEDORES 2008.
    ICO-INTERNACIONALIZACION 2008.